Конфигурация с одновременной поддержкой маркировки в ИС МП, ГИСМ, МДЛП — какие поддерживают все?

К сожалению, конфигурации, которая поддерживает все перечисленные вами группы товаров, пока не существует.
Что предлагает 1С для работы с лекарствами в «Честном ЗНАКе»:

1. «1С: Библиотека интеграции с МДЛП» — комплект механизмов, необходимых для встраивания в прикладные решения. Обеспечивают обмен данными с информационной частью ФГИС с учетом требований ФНС. Библиотеку нужно интегрировать с текущей конфигурацией. Возможно, проще будет воспользоваться готовым решением.
2. «1С: МДЛП» — облачное решение для регистрации вывода из оборота лекарственных препаратов.
3. «1С: Розница 8. Аптека» — готовое отраслевое решение для автоматизации аптек и аптечных пунктов.
4. «1С: Медицина. Больничная аптека» — решение для автоматизации учета движения лекарств внутри медорганизации любой формы собственности (в том числе государственной, например, больницы с розничным аптечным пунктом).